SUMO Protease来源于酿酒酵母，采用大肠杆菌重组表达，可以识别泛素样SUMO结构域的三级结构，并在SUMO结构域的C末端水解X-Gly-Gly-X序列中Gly-Gly键后的肽键。除了天然SUMO修饰的蛋白质外，该酶还用于切割重组SUMO融合蛋白。

SUMO Protease进行酶切时最适pH值为8.0，最佳温度为30℃，但在pH6.0-10.0、温度2~30℃和离子强度0-400mM NaCl范围内均具有较高的酶活性。此外，在还原剂DTT 0.5~2mM存在的情况下，其酶切活性更高，酶切体系中加入适当浓度DTT可显著提高酶切效率，尤其是在长时间酶切过程中，例如4ºC酶切过夜。